Hinspiele 20. September/Rückspiele 4. Oktober
FC Midtjylland/DEN - Lokomotive Moskau
FC Groningen - AC Florenz
Rabotniki Skopje/MKD - Bolton Wanderers
AEK Athen/FC Sevilla - Red Bull Salzburg
1. FC Nürnberg - Rapid Bukarest
FC Everton - Metalist Charkiw/UKR
Zenit St. Petersburg - Standard Lüttich
Bayer Leverkusen - União Leiria
FC Villarreal - BATE Borisow/BLR
FC Sion - Galatasaray Istanbul
Atletico Madrid - Erciyesspor
Girondins Bordeaux - Tampere United
Panathinaikos Athen - Artmedia Bratislava
Sparta Prag - Odense BK
FC Zürich - FC Empoli
FC Sochaux - Panionios Athen
Rapid Wien - RSC Anderlecht
FC Ferreira - AZ Alkmaar
Sampdoria Genua - Aalborg BK/DEN
Spartak Moskau - BK Häcken/SWE
Hammarby IF/SWE - SC Braga
AE Larissa - Blackburn Rovers
Mlada Boleslav/CZE - US Palermo
Dinamo Zagreb - Ajax Amsterdam
Stade Rennes - Lokomotive Sofia
Brann Bergen - FC Brügge
Bayern München - Belenenses Lissabon
FC Aberdeen - Dnjepr Dnjepropetrowsk
SC Heerenveen - Helsingborg IF
FC Toulouse - ZSKA Sofia
Hamburger SV - Litex Lowetsch/BUL
FK Sarajevo - FC Basel
Austria Wien - Vålerenga IF/NOR
AIK Solna - Hapoel Tel Aviv
Aris Saloniki - Real Saragossa
Dinamo Bukarest - IF Elfsborg/SWE
Tottenham Hotspur - Anorthosis Famagusta
RC Lens - FC Kopenhagen
FC Getafe - Twente Enschede
Groclin Grodzisk/POL - Roter Stern Belgrad